硒具有光敏性和半导体特性，在电子工业中常被用来制造光电池、感光器、激光器件、红外控制器、光电管、光敏电阻、光学仪器、光度计、整流器等。硒在电子工业领域的应用约占总需求的30%。高纯硒(99.99%)和硒合金在光电复印机中是主要吸收光的介质，用于普通纸复印机和激光印刷机的感光器。灰硒的重要特征是它具有典型的半导体性质，可用于无线电波的检波和整流。硒整流器具有耐负荷、耐高温、电稳定性好等特点。
硒能够改善钢的加工性能，因而常被应用到冶金工业中。在铸铁、不锈钢、铜合金中加入0.3%-0.5%的硒，可以提高它们的机械性能，结构更加致密，可高速切削，加工的零件表面更光洁。硒与其他元素组成的合金常用于制造低压整流器、光电池、热电材料。
硒及其化合物常被用作催化剂、硫化剂和抗氧化剂。用硒作为催化剂具有反应条件温和、成本低、环境污染小、后处理方便等优点，如单质硒是亚硫酸盐反应制备单质硫过程中的催化剂。橡胶生产过程中常用硒作为硫化剂来增强橡胶的耐磨性。
硒是动物和人体中一些抗氧化酶（谷胱甘肽过氧化物酶）和硒-P蛋白的重要组成部分，可以提高人体免疫力，对癌症、胃病、心脑血管疾病、前列腺疾病、视力疾病等有很好的防治作用，因而硒被广泛应用到医学领域，用于治疗和缓解缺硒引发的各种疾病。由于硒是人体所必须的微量元素，对人体健康有重要影响，因而医疗保健行业已经开始研发各种补硒产品，如麦芽硒。
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